Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad50P70388 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad50P70388 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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