Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxd13P70217 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxd13P70217 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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