Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb7P70195 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb7P70195 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb7P70195 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb7P70195 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb7P70195 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Psmb7P70195 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Psmb7P70195 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Psmb7P70195 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Psmb7P70195 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb7P70195 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms