Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms