Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Atp5bP56480 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp5bP56480 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms