Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atp5eP56382 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 AC158238.1-201ENSMUST00000216899 1965 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gm44597-202ENSMUST00000203287 3516 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atp5eP56382 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms