Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad23bP54728 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Rad23bP54728 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Rad23bP54728 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rad23bP54728 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad23bP54728 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Rad23bP54728 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rad23bP54728 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad23bP54728 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23bP54728 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23bP54728 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23bP54728 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23bP54728 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23bP54728 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad23bP54728 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23bP54728 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23bP54728 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23bP54728 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Rad23bP54728 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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