Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmod1P49813 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmod1P49813 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms