Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VdrP48281 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VdrP48281 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VdrP48281 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VdrP48281 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VdrP48281 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VdrP48281 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VdrP48281 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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VdrP48281 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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VdrP48281 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VdrP48281 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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