Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SrprbP47758 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms