Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms