Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms