Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clec3bP43025 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clec3bP43025 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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