Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

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Length 1,068 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pik3caP42337 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pik3caP42337 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pik3caP42337 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pik3caP42337 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pik3caP42337 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pik3caP42337 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pik3caP42337 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pik3caP42337 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms