Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Tnfsf9P41274 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Tnfsf9P41274 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Tnfsf9P41274 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Tnfsf9P41274 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Tnfsf9P41274 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Tnfsf9P41274 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Tnfsf9P41274 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Tnfsf9P41274 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Tnfsf9P41274 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf9P41274 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms