Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Mmp9P41245 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Mmp9P41245 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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