Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ThpoP40226 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms