Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PpargP37238 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpargP37238 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms