Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms