Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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