Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RxraP28700 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RxraP28700 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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