Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd10P28359 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxd10P28359 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms