Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb9P28076 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms