Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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