Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pou2f1P25425 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms