Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkchP23298 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms