Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pou3f1P21952 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms