Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sdc1P18828 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.4 ms