Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18532 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18532 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18532 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18532 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18532 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18532 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18532 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P18532 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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P18532 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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P18532 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18532 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18532 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms