Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P18530 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
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P18530 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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P18530 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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P18530 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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P18530 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P18530 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18530 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18530 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18530 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18530 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18530 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18530 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18530 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18530 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18530 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P18530 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
P18530 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
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