Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxb1P17919 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms