Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxd4P10628 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms