Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Arhgap6-202ENSMUST00000087016 1310 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb4P10284 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms