Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01638 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01638 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01638 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01638 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01638 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01638 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01638 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01638 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01638 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms