Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CcnkO88874 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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CcnkO88874 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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CcnkO88874 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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CcnkO88874 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CcnkO88874 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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CcnkO88874 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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CcnkO88874 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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CcnkO88874 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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CcnkO88874 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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CcnkO88874 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CcnkO88874 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms