Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cops6O88545 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cops6O88545 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms