Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp4O70480 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms