Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DffaO54786 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DffaO54786 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms