Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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