Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sp100O35892 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sp100O35892 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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