Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E2f3O35261 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms