Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Efna3O08545 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms