Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Speer4dL7N216 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms