Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm379J3QQ19 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms