Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Gm21887J3QQ04 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm15574-201ENSMUST00000119937 405 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 4930453O03Rik-201ENSMUST00000147594 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Ear6-202ENSMUST00000169070 893 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm21887J3QQ04 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms