Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms