Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Gm21818J3KMS6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Gm21818J3KMS6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Gm21818J3KMS6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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