Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20830J3KML6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Gm20830J3KML6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Gm20830J3KML6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Gm20830J3KML6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20830J3KML6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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