Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r34G3XA52 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms