Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rarres1F6ZIS7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms